Sau khi thành lập theo Nghị quyết số 1656/NQ-UBTVQH15 ngày 16/6/2025 của Quốc hội về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc Thành phố Hà Nội năm 2025, xã Nội Bài có 32 thôn/khu/tổ dân cư.
Căn cứ theo Nghị định số 185/2026/NĐ-CP, trong số 32 thôn/khu/tổ dân cư chỉ có 15 thôn đạt tiêu chuẩn theo quy định; 17 thôn/khu/tổ dân cư chưa đảm bảo tiêu chuẩn.
Thực hiện Đề án sắp xếp lại các thôn/khu/tổ dân cư trên địa bàn xã Nội Bài, UBND xã dự kiến sắp xếp 32 thôn/khu/tổ dân cư còn 17 thôn, trong đó giữ nguyên 05 thôn, thành lập mới 12 thôn, cụ thể:
- Các thôn giữ nguyên gồm: Thôn Phù Xá Đông (đổi tên từ thôn Đông); thôn Phù Xá Đoài (đổi tên từ thôn Đoài), thôn Hương Gia, thôn Tân Trại, thôn Xuân Bách.
- Các thôn thành lập mới gồm:
+ Thôn Thắng Lợi: Sáp nhập thôn Thắng Lợi, Khu dân cư số 2, Khu dân cư số 3, Tập thể sân bay Nội Bài;
+ Thôn Thụy Hương: Sáp nhập thôn Thụy Hương và thôn Dân cư Hàng không;
+ Thôn Trung Na: Sáp nhập thôn Na và thôn Trung;
+ Thôn Thanh Nhàn: Sáp nhập thôn Thanh Nhàn, Bái Thượng, Chợ Nga
+ Thôn Kim Anh: Sáp nhập thôn Đồi Cốc và Tổ dân cư Kim Anh;
+ Thôn Thạch Lỗi: Sáp nhập thôn Thạch Lỗi, TDC Thạch Lỗi và thôn Đồng Giá;
+ Thôn Nam Cương: Sáp nhập thôn Khu Chợ và Nam Cương:
+ Thôn Ninh Môn: Sáp nhập thôn Ninh Môn, xóm Thái Đường (thôn Tân Thái) và xóm Chùa Nấu (thôn Tân Trung Chùa);
+ Thôn Yên Ninh: Sáp nhập thôn Yên Ninh và xóm Tân An (thôn Tân Thái):
+ Thôn Hiền Lương: Sáp nhập thôn Hiền Lương và 5 xóm thuộc thôn Tân Trung Chùa gồm xóm Trung Lương, Tân Lương, Bốt Trong, Bốt Ngoài, Lan Chùa;
+ Thôn Ninh Bắc: Sáp nhập thôn Bắc Hạ, Bắc Thượng, Điền Xá;
+ Thôn Đông Lai: sáp nhập thôn Đông Lai và Quảng Hội.
Việc lấy ý kiến Nhân dân tại các thôn/khu/tổ dân cư có sáp nhập sẽ được thực hiện xong trước ngày 12/6/2026.